La Fundación SEPI fue creada por el Instituto Nacional de Industria el 10 de marzo de 1964 con el nombre inicial de Fundación Santa María del Espíritu Santo; posteriormente se cambió su denominación de forma sucesiva por la de Fundación del Instituto Nacional de Industria, Fundación Empresa Pública y Fundación SEPI, que es la que actualmente ostenta.

De conformidad con los artículos 44 de la Ley 50/2002, de 26 de diciembre, de Fundaciones y 2, apartado 1.f), de la Ley 47/2003, de 26 de noviembre, General Presupuestaria, la entidad tiene la condición de fundación del sector público estatal, por haber sido constituida con una aportación mayoritaria de la entidad pública Instituto Nacional de Industria, sucedido en la actualidad por la Sociedad Estatal de Participaciones Industriales (SEPI). La Fundación figura inscrita en el Registro de Fundaciones del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte con el número 42, lo que conlleva el reconocimiento por el Estado del interés general de sus fines.

Las actividades de la Fundación son homologables con las que forman parte del ámbito de la denominada responsabilidad social corporativa, en este caso, de su propia matriz, la SEPI. A este respecto, la Fundación concede becas de formación práctica para jóvenes titulados sin experiencia, patrocina la revista de investigación económica SERIE’s (de acceso gratuito en Internet) y la denominada Encuesta sobre Estrategias Empresariales, ambas de gran relevancia nacional e internacional. Asimismo, es la titular de un colegio mayor universitario que propugna no sólo la excelencia académica, sino una educación en valores humanos.

Pueden ser beneficiarios de la Fundación cualesquiera personas físicas o jurídicas, españolas o extranjeras, que tengan relación con los fines fundacionales o interés en los mismos. La finalidad fundacional debe beneficiar a colectividades genéricas de personas.

El gobierno, administración y representación de la Fundación se confían a su Patronato, cuya presidencia recae en el Presidente de la Sociedad Estatal de Participaciones Industriales (SEPI).

La fundación se rige por sus estatutos y por la siguiente normativa básica:

• Ley 50/2002 de 26 de diciembre, de Fundaciones.
• Ley 49/2002 de 23 de diciembre, de régimen fiscal de las entidades sin fines lucrativos y de los incentivos fiscales al mecenazgo.
• Ley 47/2003 de 26 de noviembre, General Presupuestaria.
• Real Decreto 1337/05 de 11 de noviembre, por el que se aprueba el Reglamento de fundaciones de competencia estatal.
• Real Decreto 1611/2007 de 7 de diciembre, por el que se aprueba el reglamento del registro de Fundaciones de competencia estatal.